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Frontiers in Immunology | 引人注目的金属依赖性铁死亡和铜死亡基因在低级别胶质瘤中的预后价值

Frontiers in Immunology | 引人注目的金属依赖性铁死亡和铜死亡基因在低级别胶质瘤中的预后价值
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本研究构建了基于金属基因的预后风险模型,结合TCGA和CGGA数据,有效区分低级别胶质瘤患者的生存风险,并揭示其与肿瘤突变负荷、免疫微环境及免疫检查点分子的关联,为个性化免疫治疗和化疗方案提供新思路。

 

文献概述
本文《Prognostic value of metal-based ferroptosis and cuproptosis genes and score in lower grade gliomas》,发表于Frontiers in Immunology杂志,回顾并总结了低级别胶质瘤(LGG)中金属依赖性铁死亡(ferroptosis)和铜死亡(cuproptosis)基因的预后价值。研究通过构建金属基因评分模型(MBFCGs),结合多组学数据和临床信息,深入分析了LGG患者的风险分层、免疫微环境特征及对免疫治疗和化疗的响应差异。文章还通过Kaplan-Meier分析、ROC曲线及校准图评估模型的预测性能,并利用免疫组化(IHC)验证候选基因表达。整体研究为LGG的精准治疗和预后判断提供了新的生物标志物和风险评估工具。

背景知识
低级别胶质瘤(LGG)是一类起源于中枢神经系统的低度恶性胶质瘤,其临床进展具有高度异质性,亟需精准的分子标志物用于预后判断和个体化治疗。铁死亡和铜死亡是近年来发现的非凋亡性程序性细胞死亡机制,分别由铁或铜离子诱导,涉及TCA循环及脂质过氧化等关键过程,对肿瘤微环境及免疫治疗响应具有重要影响。已有研究显示,铜离子水平与肿瘤进展密切相关,如非小细胞肺癌、三阴性乳腺癌中铜转运蛋白的调控可抑制肿瘤增殖。铁死亡相关基因如BACH1、CDCA3、TIMP1等在多种肿瘤中异常表达,可能通过影响氧化应激、脂质代谢及免疫检查点分子表达,调节肿瘤免疫逃逸及治疗响应。然而,铁死亡与铜死亡相关基因在LGG中的综合风险模型尚未建立,阻碍了其在预后评估及治疗策略中的应用。本研究首次整合铁死亡和铜死亡相关基因,构建MBFCGs评分模型,并在多个独立队列中验证其预后价值,为LGG的精准医学提供重要依据。

 

提供个性化疾病模型构建与药效评价服务,涵盖肿瘤、神经退行性疾病、代谢病等多种研究领域,支持从基因编辑到表型分析的全流程研究。

 

研究方法与实验
研究团队整合了来自TCGA和CGGA的多组学数据,共纳入529例LGG患者用于训练队列,并在CGGA1和CGGA2队列中进行外部验证。首先,利用FerrDB数据库和已有文献筛选铁死亡与铜死亡相关基因,结合相关性分析获得136个金属基因。进一步通过Lasso-Cox回归筛选24个关键基因,并通过十折交叉验证优化惩罚参数,最终通过多变量Cox回归确定BACH1、CDCA3、TIMP1为最佳预测基因。MBFCGs评分公式为:MBFCGs = 1.6265423 * BACH1 + 6.0534006 * CDCA3 + 0.4718346 * TIMP1。随后,使用Kaplan-Meier生存分析、ROC曲线及校准图评估模型预后性能,并结合临床特征构建列线图以提升预测个体生存概率。同时,利用CIBERSORT、TIDE等算法分析免疫浸润、免疫检查点表达及免疫治疗响应,并通过IHC验证BACH1在LGG组织中的表达模式。

关键结论与观点

  • MBFCGs评分模型能有效区分LGG患者的生存风险,高评分组患者总体生存期显著缩短,预后较差
  • 高MBFCGs组在GO和HALLMARK富集分析中显示神经递质受体调控、KRAS信号及Hedgehog信号通路显著上调,提示金属基因可能通过这些通路促进肿瘤进展
  • 高风险LGG患者具有更高的肿瘤突变负荷(TMB)和更低的IDH1突变率,提示其基因组不稳定性和治疗耐药性
  • 高风险组免疫浸润评分显著升高,T辅助细胞、B细胞、巨噬细胞、中性粒细胞及NK细胞水平上调,但免疫检查点分子如CD274、PDCD1表达增加,提示免疫耗竭状态
  • MBFCGs评分与TIDE算法预测的免疫治疗响应呈负相关,高风险患者可能对免疫检查点抑制剂响应较差,而低风险患者更可能获益
  • 化疗敏感性分析显示,低风险组对顺铂、伊马替尼、长春碱等药物更敏感,而高风险组对吉非替尼耐药,提示MBFCGs评分可用于指导化疗方案选择
  • 研究进一步构建了结合MBFCGs评分与临床特征(年龄、IDH突变、组织学分级)的列线图,显著提升生存预测准确性,AUC值在TCGA队列中达到0.87-0.88

研究意义与展望
本研究首次将铁死亡和铜死亡相关基因整合为MBFCGs评分模型,为LGG患者的精准预后评估和治疗决策提供有效工具。未来可进一步探索该模型在前瞻性队列中的适用性,并结合动物模型验证其在免疫治疗及靶向治疗中的预测能力。此外,BACH1、CDCA3和TIMP1的生物学功能及调控机制仍需深入解析,以开发针对金属基因通路的治疗策略。

 

提供肿瘤免疫治疗与免疫检查点研究相关的动物模型及药效评价服务,支持CAR-T、PD-1抑制剂等免疫治疗策略的临床前研究。

 

结语
本研究通过构建并验证MBFCGs风险评分模型,揭示铁死亡与铜死亡相关基因在低级别胶质瘤中的综合预后价值。该模型在多个独立队列中表现出良好的预测性能,且与免疫微环境、免疫检查点表达及化疗敏感性密切相关。研究结果为LGG患者的个体化治疗提供潜在生物标志物,并为未来靶向金属基因调控的免疫治疗策略奠定基础。进一步功能研究与临床验证将有助于推动该评分模型在临床实践中的应用,提升LGG患者的精准医疗水平。

 

文献来源:
Umair Ali Khan Saddozai, Zhendong Lu, Shuangshuang Dong, Haibo Sun, and Yajun Wang. Prognostic value of metal-based ferroptosis and cuproptosis genes and score in lower grade gliomas. Frontiers in Immunology.